More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6064 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 262 aa  530  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  64.73 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  61.78 
 
 		 261 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  61.78 
 
 		 261 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  32.52 
 
 		 510 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02777  conserved hypothetical protein  37.66 
 
 		 587 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630325  normal  0.204044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  35.27 
 
 		 425 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.02 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 284 aa  95.5  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.34 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.17 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 340 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.59 
 
 		 341 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 340 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 		 283 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 340 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 296 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 340 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 340 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  31.66 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.2 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.88 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.61 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.07 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.27 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.17 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.67 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.49 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.52 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.25 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  28.4 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.83 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>