More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1900 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  100 
 
 
275 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  96 
 
 
275 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  64.5 
 
 
265 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  62.26 
 
 
267 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  57.85 
 
 
262 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
270 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  56.78 
 
 
270 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  56.78 
 
 
270 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
273 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
271 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
282 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.13 
 
 
425 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.47 
 
 
282 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 
256 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 
256 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.56 
 
 
263 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
256 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  34.01 
 
 
260 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
260 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
268 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
286 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.86 
 
 
261 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
279 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
271 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.35 
 
 
259 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
284 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
271 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
278 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
246 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 
277 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.11 
 
 
256 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 
265 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  34.81 
 
 
276 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.3 
 
 
260 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.3 
 
 
260 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
282 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
263 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
277 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
260 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
259 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.71 
 
 
265 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
277 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31.97 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
251 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.74 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.02 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  33.21 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  34.54 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  28.63 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
268 aa  95.5  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.29 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 
257 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 
257 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
261 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 
257 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
270 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
254 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.9 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
263 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.29 
 
 
270 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.49 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>