More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4321 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  73.28 
 
 
275 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  70.93 
 
 
275 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  72.55 
 
 
269 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
277 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 
277 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  39.6 
 
 
292 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
277 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  38.89 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  41.27 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
282 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  38.89 
 
 
282 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
282 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  38.1 
 
 
259 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  34.63 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.47 
 
 
425 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  32.05 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  35.18 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  37.12 
 
 
263 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  35.9 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.25 
 
 
259 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  36.67 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  35.47 
 
 
263 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  35.47 
 
 
261 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.85 
 
 
279 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  35.47 
 
 
261 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
263 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  36.05 
 
 
265 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.91 
 
 
265 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 
263 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 
272 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  34.03 
 
 
263 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  35.37 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  35.37 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  35.37 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  35.42 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  35.42 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
279 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  35.42 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  35.42 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  35.42 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  32.35 
 
 
260 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.35 
 
 
260 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  34.59 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  33.82 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
265 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  32.66 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.61 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.87 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.84 
 
 
265 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  34.39 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.23 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  34.39 
 
 
266 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
246 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  38.33 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.02 
 
 
256 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.02 
 
 
256 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  31.05 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.02 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  31.52 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.31 
 
 
260 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.52 
 
 
393 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
262 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  33.19 
 
 
263 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.97 
 
 
261 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
254 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  29.72 
 
 
264 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 
396 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  29.25 
 
 
260 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  32.45 
 
 
268 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
270 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
281 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
277 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  33.17 
 
 
263 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 
260 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  30.38 
 
 
256 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
275 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
270 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  33.45 
 
 
393 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.48 
 
 
263 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
386 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
264 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  34.8 
 
 
260 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.62 
 
 
262 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
263 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
260 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.23 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  32.82 
 
 
265 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>