More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1483 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  80.36 
 
 
295 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  53.7 
 
 
275 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
270 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
264 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
268 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
276 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
276 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  30.94 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  30.29 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
248 aa  95.5  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
267 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.31 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
268 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
268 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
302 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
264 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.62 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.3 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.71 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.33 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  39.5 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.74 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.99 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.33 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.1 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  27.54 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.98 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  35.88 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.84 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.52 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.38 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.83 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.86 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>