More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5093 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 516 aa  1027    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  73.15 
 
 		 514 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  64.98 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  43.8 
 
 		 378 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  38.15 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  37.5 
 
 		 396 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  35.61 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  37.18 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  37.18 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  37.18 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  36.69 
 
 		 396 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 363 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 1064 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  35.56 
 
 		 1067 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 361 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 1050 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.82 
 
 		 1029 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.11 
 
 		 1055 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  30.99 
 
 		 1143 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.18 
 
 		 1044 aa  90.1  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  33.73 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  31.84 
 
 		 1139 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 352 aa  87  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.81 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.41 
 
 		 1056 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  31.35 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  34.31 
 
 		 1075 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.88 
 
 		 996 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.81 
 
 		 713 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.19 
 
 		 1034 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.53 
 
 		 1013 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  30.64 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 992 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.72 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  30.72 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  30.72 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 636 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.5 
 
 		 1126 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.53 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  27.19 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 1216 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 278 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  25.76 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  29.57 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 		 386 aa  67  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 1089 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3869  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  39.23 
 
 		 188 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 		 270 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.2 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  30.46 
 
 		 914 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.94 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  26.06 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  26.06 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.72 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 1190 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  27.67 
 
 		 641 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  25.7 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 		 356 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 284 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  26.06 
 
 		 287 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  24.08 
 
 		 281 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 279 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.88 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  32.05 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 273 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  25.7 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>