More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1710 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 413 aa  818    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  37.53 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  38.02 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  38.02 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  38.02 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  37.04 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  37.94 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  31.99 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  31.11 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  51.02 
 
 		 518 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  30.85 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  51.04 
 
 		 525 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  43.56 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  34.12 
 
 		 514 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  38.1 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  36.67 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  38.05 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  44.55 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  28.9 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  36 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4743  transcriptional regulator, CadC  34.23 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.274982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  40.43 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.64 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  30.17 
 
 		 977 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  31.63 
 
 		 717 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  29.17 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.04 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  28.57 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  28.2 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.46 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00207  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.01 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  31.88 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002187  transcriptional activator of cad operon  32.04 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000411708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  28.83 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3769  DNA-binding transcriptional activator CadC  28.69 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000389639  normal  0.0128814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  29.76 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  27.93 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  27.93 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.22 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 468 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  27.93 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  27.93 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  27.93 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  27.93 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  29.39 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  28.12 
 
 		 678 aa  57  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  27.93 
 
 		 512 aa  57  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  25.78 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 		 260 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  25.78 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.23 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  23.86 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  24.72 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  21.75 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  26.8 
 
 		 233 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  25.82 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 1020 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 259 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  21.97 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  29.41 
 
 		 729 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  25 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>