More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0600 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 
540 aa  1062    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  53 
 
 
361 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  54.11 
 
 
413 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  54.11 
 
 
413 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  54.11 
 
 
413 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  53.26 
 
 
409 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  53.6 
 
 
436 aa  267  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 
363 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 
352 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  41.43 
 
 
413 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  32.66 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 
378 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 
352 aa  127  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 
526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 
516 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  32.27 
 
 
396 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  31.49 
 
 
396 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  32.32 
 
 
396 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
266 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
285 aa  84  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  31.77 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
265 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
264 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
265 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.07 
 
 
308 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 
261 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.23 
 
 
264 aa  77  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
277 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
280 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.32 
 
 
264 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
259 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
260 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.85 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  26.14 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.65 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  26.84 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.41 
 
 
251 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  25.27 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
267 aa  73.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
275 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  30.89 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
235 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.83 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.83 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 
305 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
275 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.36 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.64 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  28.32 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  25.97 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  25.97 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  28.07 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  25.7 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.21 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.21 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.26 
 
 
273 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  23.83 
 
 
269 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  30 
 
 
302 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  25.74 
 
 
269 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.45 
 
 
263 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
352 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.77 
 
 
262 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.61 
 
 
268 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.17 
 
 
1050 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  24.88 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
269 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  28.84 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  24.22 
 
 
269 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  24.88 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  26.25 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  24.38 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  31.42 
 
 
1034 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>