More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1797 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
298 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  31.3 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 
283 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  31.67 
 
 
319 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  29.29 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  31.43 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  26.12 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  32.4 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  31.82 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  27.44 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  32.17 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  28.06 
 
 
318 aa  82  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  26.87 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  29.12 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  27.72 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  29.39 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  28.67 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  25.25 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.96 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  27.8 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  29.39 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
291 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  25.77 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  28.92 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0720  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.86668  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  24.57 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  30.18 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  24.83 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  29.82 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  24.92 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  27.55 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  31.18 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  24.92 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  25.25 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.61 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  26.16 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  38.35 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  24.92 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  27.93 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  29.69 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  29.62 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  27.93 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  26.73 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  25.96 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  24.58 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  27.18 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  26.85 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  28.97 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  29.86 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  28.97 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  28.97 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2752  hydrolase, alpha/beta fold family  27.76 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  26.95 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  27.96 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  35.94 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  26.76 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  29.72 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  27.37 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  29.72 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  23.1 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  26.35 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  27.08 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.07 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  30.37 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  25.44 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  27.12 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2487  Prolyl aminopeptidase  29.49 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  29.5 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  29.66 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  29.22 
 
 
540 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  24.25 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  25.44 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  26.35 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  28.77 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  33.05 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  29.58 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  29.58 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  34.96 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  29.93 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  26.57 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>