More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4136 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 
262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1566  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
277 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  40.49 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  42.68 
 
 
254 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 
262 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
262 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6278  Alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
282 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 
397 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  42.34 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  32.02 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.48 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  39.83 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.77 
 
 
367 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.23 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.26 
 
 
372 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.58 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.4 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.31 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.24 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.85 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  33.48 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  27.49 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.54 
 
 
368 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.99 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
290 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  39.2 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  22.75 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>