More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6247 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 352 aa  715    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  48.36 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  48.36 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  48.36 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  47.27 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  46.18 
 
 		 436 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 540 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  37.94 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  34.17 
 
 		 514 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  29.84 
 
 		 516 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  31.33 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  30.33 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  31.19 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5299  hypothetical protein  57.75 
 
 		 96 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.87 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.78 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.85 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.64 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  29.8 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.58 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  29.26 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  29.02 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.39 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.47 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.62 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 222 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  24.54 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  26.32 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.14 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.24 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  24.55 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.75 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  26.78 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  24.55 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  29.95 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  25.34 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.24 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>