More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2970 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 
396 aa  753    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  98.66 
 
 
396 aa  707    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  88.47 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 
378 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  39.37 
 
 
514 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 
516 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 
526 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 
413 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 
413 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 
413 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  35.77 
 
 
409 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  33.85 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
449 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
449 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
449 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.11 
 
 
413 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  53.77 
 
 
584 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  30 
 
 
462 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  32.27 
 
 
540 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  32.96 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
235 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  46.08 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 
296 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  39.66 
 
 
522 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  40.82 
 
 
972 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
265 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  39 
 
 
531 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  30.06 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  42.16 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  37.4 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  39.81 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  30.58 
 
 
711 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  31.56 
 
 
292 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.86 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  39.22 
 
 
521 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  39.26 
 
 
521 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 
950 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
270 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  37.72 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  43.68 
 
 
921 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
266 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
305 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  27.59 
 
 
272 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
273 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
297 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
266 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
226 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
275 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
340 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
261 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
300 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
271 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  34.38 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
257 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
279 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
317 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  31.66 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.42 
 
 
258 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  27.64 
 
 
693 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
330 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  30.93 
 
 
756 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
280 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
302 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  43.52 
 
 
531 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6027  transcriptional regulator, CadC  35.58 
 
 
188 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0284754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 
267 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  35.65 
 
 
591 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  31.51 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
272 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  41.49 
 
 
479 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
284 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
331 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 
901 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
338 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  24.17 
 
 
301 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  33.7 
 
 
277 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  21.16 
 
 
246 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  31.16 
 
 
266 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
712 aa  59.7  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
272 aa  59.7  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>