More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7386 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  100 
 
 		 514 aa  1015    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  72.76 
 
 		 516 aa  688    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  62.06 
 
 		 526 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  41.18 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  39.37 
 
 		 396 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  38.58 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  33.39 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 		 449 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 		 449 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 		 449 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  31.88 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  37.13 
 
 		 409 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  36.75 
 
 		 1029 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  35.4 
 
 		 1067 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  34.31 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.31 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  34.31 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 1064 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  33.81 
 
 		 436 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  34.27 
 
 		 1075 aa  93.6  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.84 
 
 		 1055 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  32.78 
 
 		 1013 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.12 
 
 		 413 aa  87  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.12 
 
 		 1056 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  31.17 
 
 		 1143 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 1050 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 992 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.46 
 
 		 1034 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  31.17 
 
 		 1044 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.93 
 
 		 996 aa  80.5  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  32.93 
 
 		 1126 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.71 
 
 		 1163 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 273 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.86 
 
 		 1139 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  29.86 
 
 		 272 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  28.14 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.23 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  27.24 
 
 		 1145 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 278 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.26 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.41 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 636 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 273 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 265 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 1216 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 280 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.11 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 250 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3869  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  33.82 
 
 		 188 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386514 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.91 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.76 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.02 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  27.62 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 261 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 1116 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 284 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.78 
 
 		 256 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.5 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 1089 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  28.32 
 
 		 273 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 275 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.23 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.8 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 269 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>