More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0901 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 360 aa  718    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.9 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  44.72 
 
 		 364 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 350 aa  228  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  41.06 
 
 		 423 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.85 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  42.22 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.38 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  36.42 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  52.05 
 
 		 297 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.86 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  33.98 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  32.38 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  30.03 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.71 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.17 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.67 
 
 		 392 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.22 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.62 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  31.37 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.15 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  28.41 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  21.18 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.12 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  28.41 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.52 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.19 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  22.64 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  24.25 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  24.25 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  26.55 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.32 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  27.45 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>