More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1079 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
283 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
290 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
333 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
295 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
287 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
291 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
284 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
314 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  34.86 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  34.86 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.48 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  33.91 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.27 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  33.62 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.4 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  30.46 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
405 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  23.42 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 
350 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.09 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.21 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.35 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  27.24 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.48 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  22.99 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.66 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  31.62 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.73 
 
 
562 aa  73.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  25.91 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  24.36 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  25.64 
 
 
571 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>