More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2475 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  56.84 
 
 		 286 aa  332  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  30.47 
 
 		 314 aa  128  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  33.22 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  28.43 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  29.28 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  29.47 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  31.72 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  26.86 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  26.86 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.62 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  43.55 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  29.79 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  40.56 
 
 		 405 aa  98.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  30.13 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  29.02 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11214  hypothetical protein  27.57 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00241452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  28.73 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 354 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  27.76 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 927 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  29.23 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 861 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  27.62 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.15 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  30.85 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  38.17 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  38.61 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  35.66 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  35.88 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  29.21 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 875 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  35.25 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>