More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1777 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 324 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  40.51 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  42.54 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  40.57 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  39.62 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  38.34 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  41.59 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  37.31 
 
 		 302 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  37.46 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  38.23 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  37.94 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  36 
 
 		 306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  34.95 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  34.95 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  34.95 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  36.42 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.23 
 
 		 461 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  49.57 
 
 		 118 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.77 
 
 		 482 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  30.28 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.14 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.84 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.58 
 
 		 484 aa  113  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  24.62 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.74 
 
 		 411 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  42.19 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.13 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 304 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 		 304 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 302 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  38.76 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  37.5 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.76 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  26.42 
 
 		 287 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.81 
 
 		 475 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  38.66 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  27.48 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.21 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.3 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  34.43 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  33.53 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  26.13 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  26.57 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  25.56 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  26.57 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.85 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.59 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>