More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02319 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 306 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  55.37 
 
 		 302 aa  362  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  54.15 
 
 		 303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  52.94 
 
 		 306 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  52.68 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  52.35 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  50 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  48.34 
 
 		 310 aa  318  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  46.36 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  47.67 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  48.68 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  48.68 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  48.68 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  46.84 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  44.75 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 289 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.21 
 
 		 461 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.97 
 
 		 482 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.38 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  47.15 
 
 		 118 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  30.42 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.31 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  26.84 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  27.5 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.94 
 
 		 475 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.28 
 
 		 369 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  28.21 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 861 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  24.84 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  27.08 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  23.76 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  26.8 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  34.82 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.64 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  34.23 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  23.95 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  22.84 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.26 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  22.71 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  23.18 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  24.39 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  23.59 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.28 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>