More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0901 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
298 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  53.19 
 
 
282 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
282 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  47.84 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  47.84 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  47.5 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  32.83 
 
 
302 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  31.54 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  31.34 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
299 aa  92.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  31.18 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  31.18 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  31.18 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  29.57 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  30.53 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  24.33 
 
 
293 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  24.14 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
284 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  30.71 
 
 
314 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  27.3 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.54 
 
 
318 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.15 
 
 
300 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
339 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 
310 aa  85.5  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  24.46 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.04 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  28.96 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  27.7 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  43.09 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  35.56 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  25.57 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  39.66 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  30.04 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  29.85 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  27.27 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  27.27 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>