More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3197 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  87.33 
 
 		 302 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  66.67 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  68.33 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  68.33 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  68.33 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  59.93 
 
 		 298 aa  359  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  50.66 
 
 		 303 aa  333  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  53.51 
 
 		 302 aa  331  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  50.17 
 
 		 302 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  48.34 
 
 		 306 aa  318  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  48.34 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  50.99 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  46.67 
 
 		 299 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  49 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  47.33 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  45.58 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.06 
 
 		 461 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  63.03 
 
 		 118 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.13 
 
 		 484 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.63 
 
 		 482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  32.09 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.78 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  32.04 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  29.97 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.36 
 
 		 411 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  31.68 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.7 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  32.98 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  32.98 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  28.9 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  30.32 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.88 
 
 		 475 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.42 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  31.54 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.49 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  41.13 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  28.81 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  39.2 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  41.32 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  31.37 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  30.03 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 288 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  43.09 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.14 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  36.02 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>