More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2620 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
330 aa  672    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  42.71 
 
 
301 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  40.64 
 
 
302 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  40.64 
 
 
293 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  44.29 
 
 
300 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  43.21 
 
 
295 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  41.95 
 
 
294 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  43.67 
 
 
300 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  39.73 
 
 
296 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  40.93 
 
 
292 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  39.37 
 
 
287 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  41.87 
 
 
298 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
290 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
291 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
289 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  30.99 
 
 
314 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  32.67 
 
 
298 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
298 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
300 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.3 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
302 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.49 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 
318 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  32.87 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
299 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.87 
 
 
286 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  31.89 
 
 
302 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  31.68 
 
 
310 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  30.85 
 
 
303 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 
294 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  31.19 
 
 
307 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 
278 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  32.16 
 
 
302 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
296 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
293 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
296 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  29.94 
 
 
299 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
299 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  30.16 
 
 
302 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  30.88 
 
 
302 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  28.52 
 
 
306 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  26.58 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  26.44 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  33.49 
 
 
304 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 
304 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  29.93 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  27.17 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11214  hypothetical protein  32.68 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00241452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  50 
 
 
118 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  22.64 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  21.6 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.19 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  30 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  30 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  30 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  36.89 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  27.57 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  26.8 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.87 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>