More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4004 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  84.75 
 
 		 298 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  63.03 
 
 		 310 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  63.03 
 
 		 302 aa  153  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  60.98 
 
 		 303 aa  153  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  58.54 
 
 		 302 aa  151  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  58.54 
 
 		 306 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  58.54 
 
 		 302 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  55.46 
 
 		 299 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  59.35 
 
 		 300 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  57.72 
 
 		 302 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  55.65 
 
 		 303 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  49.57 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  54.03 
 
 		 304 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  54.03 
 
 		 304 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  54.03 
 
 		 304 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  47.15 
 
 		 306 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.22 
 
 		 461 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  48.7 
 
 		 289 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 		 299 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.54 
 
 		 482 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.9 
 
 		 363 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.59 
 
 		 484 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  49.02 
 
 		 307 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.4 
 
 		 411 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  48.04 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  48.04 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  48.04 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  50 
 
 		 314 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  49.56 
 
 		 304 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  49.56 
 
 		 304 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.66 
 
 		 369 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 		 296 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  50 
 
 		 330 aa  83.6  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  44.25 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.44 
 
 		 361 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  49.46 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.62 
 
 		 361 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  46.24 
 
 		 293 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  44.33 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  44.23 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  43.27 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  44.44 
 
 		 304 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 291 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 293 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  36.54 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  44.58 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 297 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  42.16 
 
 		 300 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  43.37 
 
 		 300 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.49 
 
 		 475 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  48.72 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 301 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.94 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  37.62 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 		 405 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 		 321 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  44.59 
 
 		 315 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.11 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  35.58 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 282 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  39.8 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  42.03 
 
 		 287 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  38.78 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 307 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 297 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  43.16 
 
 		 330 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  44.29 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  47.89 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  41.58 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>