More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2625 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
314 aa  641    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  40.69 
 
 
308 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 
302 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
302 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
302 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  39.59 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  39.66 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  39.38 
 
 
301 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
339 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
339 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  38.23 
 
 
297 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
291 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
295 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
294 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 
297 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
296 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
296 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
300 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 
294 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
296 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
298 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  36.1 
 
 
294 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  33.68 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  35.14 
 
 
310 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 
299 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
301 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  34.68 
 
 
301 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  32.63 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  36.27 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  35.5 
 
 
302 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  35.69 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  33.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  30.43 
 
 
302 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  30 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
299 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  33.56 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  33.69 
 
 
302 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.55 
 
 
461 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  34.22 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  34.83 
 
 
304 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
287 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
289 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  33.11 
 
 
298 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
861 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  32.04 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  30.54 
 
 
330 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
875 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  32.72 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  32.72 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  32.72 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  30.54 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
282 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  30.42 
 
 
306 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  28.03 
 
 
296 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
300 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  31.71 
 
 
292 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
324 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 
294 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  30.43 
 
 
301 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  28.52 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  32.01 
 
 
303 aa  99  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.5 
 
 
922 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  42.73 
 
 
409 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
915 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.22 
 
 
978 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
288 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.43 
 
 
363 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
296 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  45.22 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.57 
 
 
922 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
284 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  46.46 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  28.28 
 
 
287 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  46.46 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
323 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
287 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>