More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4241 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 875 aa  1671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  47.41 
 
 		 927 aa  674    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  49.67 
 
 		 922 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  50.68 
 
 		 861 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  46.7 
 
 		 899 aa  625  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  45.48 
 
 		 915 aa  582  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  45.18 
 
 		 922 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.01 
 
 		 978 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  33.84 
 
 		 542 aa  255  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  33.14 
 
 		 546 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  33.02 
 
 		 546 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  33.89 
 
 		 545 aa  245  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  32.64 
 
 		 564 aa  234  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  33.15 
 
 		 544 aa  234  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 564 aa  224  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  32.71 
 
 		 555 aa  221  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  30.61 
 
 		 564 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  34.39 
 
 		 556 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  31.7 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  34.22 
 
 		 564 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  29.29 
 
 		 563 aa  205  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  29.43 
 
 		 614 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  34.24 
 
 		 552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  29.34 
 
 		 608 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  32.85 
 
 		 548 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  33.21 
 
 		 548 aa  196  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  29.51 
 
 		 573 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  28.83 
 
 		 613 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  29.57 
 
 		 554 aa  196  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  30.08 
 
 		 574 aa  195  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  29.06 
 
 		 585 aa  193  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  29.7 
 
 		 571 aa  190  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  28.99 
 
 		 624 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  28.86 
 
 		 608 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  29.33 
 
 		 628 aa  187  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  29.29 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  29.54 
 
 		 624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  28.73 
 
 		 629 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  28.86 
 
 		 608 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  23.54 
 
 		 525 aa  164  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  29.42 
 
 		 581 aa  158  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 298 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 		 300 aa  147  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 294 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 293 aa  144  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 		 300 aa  144  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 299 aa  144  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  35.36 
 
 		 294 aa  143  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 301 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 291 aa  138  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 296 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 290 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 297 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 339 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 339 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 296 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 302 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 320 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  34 
 
 		 310 aa  134  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 308 aa  133  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 297 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 		 318 aa  132  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 302 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 302 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 302 aa  131  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 303 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 295 aa  129  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  34 
 
 		 300 aa  127  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 		 296 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 		 294 aa  125  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  28.63 
 
 		 504 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 509 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  33.84 
 
 		 301 aa  114  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02820  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.14 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  32.21 
 
 		 314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  25.72 
 
 		 495 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.54 
 
 		 527 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  28.22 
 
 		 504 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 662 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 301 aa  111  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 501 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 487 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  27.64 
 
 		 504 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.95 
 
 		 513 aa  110  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1133  hypothetical protein  24.89 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 490 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  28.34 
 
 		 506 aa  107  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 502 aa  106  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 504 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  28.63 
 
 		 510 aa  105  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  28.6 
 
 		 510 aa  105  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 529 aa  105  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 525 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.91 
 
 		 514 aa  104  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.47 
 
 		 553 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.21 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  27.37 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  27.63 
 
 		 539 aa  102  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  28.23 
 
 		 510 aa  102  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>