More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1953 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 525 aa  1065    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  28.36 
 
 		 544 aa  210  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  28.95 
 
 		 545 aa  203  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  26.78 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  26.33 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  27.83 
 
 		 546 aa  197  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  25.92 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  27.68 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  25.78 
 
 		 556 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  28.96 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 564 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  25.29 
 
 		 552 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.84 
 
 		 922 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  26.64 
 
 		 564 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  26.32 
 
 		 614 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  24.73 
 
 		 555 aa  166  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  25.49 
 
 		 564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  25.65 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  26.27 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  23.45 
 
 		 581 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  24.95 
 
 		 608 aa  163  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  25.31 
 
 		 608 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  24.31 
 
 		 927 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  25.56 
 
 		 613 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  25.5 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  25.57 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  24.39 
 
 		 624 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  24.44 
 
 		 628 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  24.65 
 
 		 624 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  22.54 
 
 		 875 aa  156  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  25.09 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  24.78 
 
 		 629 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  25.51 
 
 		 598 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  24.74 
 
 		 573 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  25.77 
 
 		 585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.23 
 
 		 978 aa  147  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.48 
 
 		 899 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  23.4 
 
 		 571 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  22.29 
 
 		 922 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.91 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  23.75 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  23.51 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  22.22 
 
 		 915 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  24.34 
 
 		 539 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  21.58 
 
 		 861 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  25.05 
 
 		 587 aa  123  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  23.53 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.42 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.91 
 
 		 524 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  24.41 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  23.98 
 
 		 520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  23.39 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  22.13 
 
 		 531 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  22.36 
 
 		 537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  23.84 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  23.47 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.58 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  23.26 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  22.41 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  22.41 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  23.65 
 
 		 515 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  23.49 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  22.76 
 
 		 508 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  24.06 
 
 		 546 aa  110  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  21.4 
 
 		 570 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  23.87 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.4 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  23.52 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  22.69 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  23.91 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  22.26 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.85 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.78 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  20.9 
 
 		 973 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.62 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  23.48 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.57 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  23.74 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.89 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  22.99 
 
 		 566 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  23.53 
 
 		 546 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  24.9 
 
 		 521 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  23.53 
 
 		 546 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  23.53 
 
 		 546 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  23.53 
 
 		 546 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  20.92 
 
 		 557 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  21.27 
 
 		 542 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  22.53 
 
 		 502 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  23.4 
 
 		 500 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.89 
 
 		 518 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  23.4 
 
 		 500 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  23.58 
 
 		 520 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  22.72 
 
 		 550 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.67 
 
 		 518 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.14 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>