More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1468 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  71.45 
 
 		 552 aa  767    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  71.66 
 
 		 556 aa  796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  96.53 
 
 		 548 aa  1055    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  100 
 
 		 548 aa  1097    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  50.45 
 
 		 546 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  49.45 
 
 		 542 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  49.91 
 
 		 546 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  50 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  50.54 
 
 		 544 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  47.86 
 
 		 564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  44.91 
 
 		 564 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  44.27 
 
 		 563 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  44.07 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  42.16 
 
 		 614 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  43.23 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  43.4 
 
 		 574 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  41.65 
 
 		 608 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  41.32 
 
 		 613 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  41.89 
 
 		 608 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  42.06 
 
 		 608 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  42.09 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  45.01 
 
 		 564 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  41.08 
 
 		 624 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  41.4 
 
 		 624 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  40.9 
 
 		 629 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  40.27 
 
 		 628 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  40.61 
 
 		 554 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  40.11 
 
 		 573 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  43.26 
 
 		 564 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  41.32 
 
 		 598 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  42.03 
 
 		 555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  34.09 
 
 		 581 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.52 
 
 		 922 aa  216  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.7 
 
 		 978 aa  210  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 927 aa  209  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.9 
 
 		 899 aa  204  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 875 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 861 aa  183  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.02 
 
 		 922 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 915 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 525 aa  163  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 		 552 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 519 aa  114  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 		 893 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 536 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  24.03 
 
 		 662 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  24.06 
 
 		 518 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 		 530 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 		 555 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  25.41 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  24.8 
 
 		 555 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  27.44 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  24.39 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  24.67 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 535 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 553 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 520 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.44 
 
 		 570 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  23.33 
 
 		 551 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.42 
 
 		 514 aa  98.2  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  27.01 
 
 		 528 aa  97.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.11 
 
 		 579 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 		 495 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.22 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10576  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 1704 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  26.39 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 		 550 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 527 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 515 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0581  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 526 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.02 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 807 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  26.56 
 
 		 536 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 517 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 559 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.95 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.29 
 
 		 514 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  24.85 
 
 		 556 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  25.62 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 508 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 		 506 aa  91.3  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1101  AMP-dependent synthetase and ligase  26.21 
 
 		 518 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.929739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  25.19 
 
 		 574 aa  90.9  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 525 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  26.41 
 
 		 622 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  23.72 
 
 		 571 aa  90.9  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2154  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 513 aa  90.5  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 536 aa  90.1  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  25.96 
 
 		 575 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3401  AMP-dependent synthetase and ligase  22.29 
 
 		 1084 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1713  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  28.26 
 
 		 1368 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 514 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  24.17 
 
 		 2352 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2052  amino acid adenylation  24.44 
 
 		 1103 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>