More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2734 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  62.01 
 
 		 598 aa  726    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  69.35 
 
 		 614 aa  797    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  71.43 
 
 		 585 aa  833    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  70 
 
 		 608 aa  801    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  69.26 
 
 		 563 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  67.9 
 
 		 629 aa  785    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  64.84 
 
 		 571 aa  748    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  68.14 
 
 		 624 aa  785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  100 
 
 		 573 aa  1185    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  68.14 
 
 		 624 aa  785    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  68.01 
 
 		 628 aa  785    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  68.17 
 
 		 613 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  69.92 
 
 		 608 aa  810    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  72.31 
 
 		 574 aa  833    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  67.79 
 
 		 564 aa  788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  69.58 
 
 		 608 aa  802    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  60.99 
 
 		 564 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  64.13 
 
 		 554 aa  727    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  48.51 
 
 		 545 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  47.78 
 
 		 546 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  48.13 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  48.93 
 
 		 542 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  48.77 
 
 		 544 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.54 
 
 		 564 aa  472  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  44.01 
 
 		 564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  41.92 
 
 		 564 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  41.68 
 
 		 552 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  40.45 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  40.53 
 
 		 548 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  40.11 
 
 		 548 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  36.41 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  31.66 
 
 		 581 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.52 
 
 		 922 aa  219  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 927 aa  200  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 875 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.78 
 
 		 899 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.88 
 
 		 922 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 915 aa  181  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.26 
 
 		 978 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 861 aa  171  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 		 525 aa  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 		 511 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 536 aa  112  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  22.98 
 
 		 527 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  24.62 
 
 		 662 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  25.53 
 
 		 2571 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  25.53 
 
 		 2571 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  23.39 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  24.15 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  23.52 
 
 		 519 aa  107  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 532 aa  107  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  24.12 
 
 		 510 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  24.06 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  23.83 
 
 		 525 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 		 553 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 512 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 		 521 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.55 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.88 
 
 		 497 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 		 552 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 		 508 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.1 
 
 		 516 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  27.69 
 
 		 6272 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  27.69 
 
 		 6274 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  23.82 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.58 
 
 		 513 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  27.69 
 
 		 6271 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 		 630 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  24.11 
 
 		 500 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  23.34 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5071  AMP-dependent synthetase and ligase  24.9 
 
 		 496 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  23.82 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  24.11 
 
 		 500 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  23.83 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 		 500 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  23.92 
 
 		 590 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 564 aa  98.6  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  24.35 
 
 		 529 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.88 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 508 aa  97.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  23.88 
 
 		 500 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 518 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 539 aa  97.4  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.34 
 
 		 514 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  23.88 
 
 		 500 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  23.92 
 
 		 548 aa  96.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  24.82 
 
 		 534 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  25.05 
 
 		 552 aa  96.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1726  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.71 
 
 		 1147 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  23.91 
 
 		 558 aa  95.9  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.91 
 
 		 560 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  23.76 
 
 		 591 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>