More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1943 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 560 aa  1168    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.89 
 
 		 571 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.84 
 
 		 559 aa  726    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.73 
 
 		 553 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2341  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  83.48 
 
 		 560 aa  978    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.42 
 
 		 563 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.42 
 
 		 565 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.68 
 
 		 566 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.57 
 
 		 568 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.39 
 
 		 568 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.58 
 
 		 568 aa  611  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6849  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.38 
 
 		 586 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  51.47 
 
 		 559 aa  589  1e-167  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.1 
 
 		 569 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.29 
 
 		 564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.1 
 
 		 551 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.07 
 
 		 567 aa  562  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.86 
 
 		 565 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  50.46 
 
 		 563 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.95 
 
 		 559 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.55 
 
 		 575 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.27 
 
 		 564 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.09 
 
 		 562 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4155  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.2 
 
 		 584 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5508  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  43.35 
 
 		 675 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.42 
 
 		 561 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 		 561 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.74 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.61 
 
 		 563 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.26 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 577 aa  352  1e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 552 aa  345  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 569 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 551 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 539 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 583 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 579 aa  336  5.999999999999999e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 		 551 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 565 aa  335  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 591 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 512 aa  327  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 532 aa  326  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 590 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 555 aa  323  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.22 
 
 		 555 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 543 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 527 aa  316  9e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 548 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 564 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 553 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 577 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 584 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 585 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 527 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.14 
 
 		 510 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 514 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 544 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 510 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0064  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  33.76 
 
 		 601 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 510 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.49 
 
 		 562 aa  296  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 550 aa  296  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 510 aa  296  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 510 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 510 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 510 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 510 aa  293  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 518 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1573  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.750238  hitchhiker  0.00328561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  32.47 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.23 
 
 		 561 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 		 510 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>