More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3345 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  71.65 
 
 
590 aa  878    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  60.53 
 
 
578 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  70.96 
 
 
591 aa  875    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
577 aa  1193    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  50.95 
 
 
565 aa  586  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  52.17 
 
 
561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  50.26 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
566 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  48.7 
 
 
559 aa  559  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  48.26 
 
 
551 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.08 
 
 
563 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.08 
 
 
563 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.08 
 
 
582 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.08 
 
 
563 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.73 
 
 
561 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.08 
 
 
561 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.9 
 
 
561 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.08 
 
 
563 aa  538  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.73 
 
 
582 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  47.5 
 
 
569 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.38 
 
 
561 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.64 
 
 
561 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  48.66 
 
 
549 aa  508  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  45.55 
 
 
573 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.1 
 
 
585 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  44.76 
 
 
584 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  45 
 
 
583 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  43.9 
 
 
564 aa  478  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  45.45 
 
 
543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 
584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  44.93 
 
 
539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  43.49 
 
 
558 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 
585 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 
560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 
575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 
583 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  41.44 
 
 
584 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  44.17 
 
 
544 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 
584 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  40.28 
 
 
569 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 
564 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  41.26 
 
 
560 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.7 
 
 
557 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  40.24 
 
 
569 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  41.27 
 
 
584 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 
567 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  41.27 
 
 
584 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 
552 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  41.27 
 
 
584 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.32 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.32 
 
 
557 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  40.99 
 
 
584 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.32 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 
549 aa  419  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.53 
 
 
558 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  41.44 
 
 
554 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.67 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.67 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  39.34 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
564 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 
586 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.49 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 
559 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.91 
 
 
557 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 
561 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 
561 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 
561 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 
561 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.7 
 
 
561 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.15 
 
 
557 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 
591 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  41.52 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.18 
 
 
561 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  40.6 
 
 
558 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.52 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  41.52 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.7 
 
 
561 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.46 
 
 
557 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.72 
 
 
561 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.03 
 
 
561 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 
549 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.86 
 
 
560 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.52 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.52 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
559 aa  412  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 
559 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
583 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.03 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.31 
 
 
569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 
583 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.15 
 
 
557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1276  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.17 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.011036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1035  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.17 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.526739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.17 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0305097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.52 
 
 
560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1957  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.17 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000391168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1764  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.17 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022418  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1803  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.17 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>