More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1593 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
559 aa  1144    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  74.33 
 
 
561 aa  888    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  58.69 
 
 
565 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  53.96 
 
 
566 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.81 
 
 
561 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.63 
 
 
561 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.61 
 
 
582 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.81 
 
 
563 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.99 
 
 
563 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.91 
 
 
561 aa  588  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.81 
 
 
582 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.81 
 
 
563 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.81 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.25 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.81 
 
 
563 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  55.01 
 
 
549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  51.34 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  50.61 
 
 
578 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  49.55 
 
 
569 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  49.3 
 
 
591 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  48.7 
 
 
577 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 
590 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  48.56 
 
 
573 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  48.09 
 
 
583 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.73 
 
 
585 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  50.55 
 
 
539 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  46.95 
 
 
585 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  46.17 
 
 
564 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  46.67 
 
 
551 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  46.4 
 
 
584 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  45.05 
 
 
558 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  43.32 
 
 
575 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  43.09 
 
 
584 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  43.2 
 
 
564 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 
560 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  42.76 
 
 
577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  44.48 
 
 
543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  42.14 
 
 
549 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  40.99 
 
 
577 aa  427  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.5 
 
 
557 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
554 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  40.99 
 
 
599 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.32 
 
 
561 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  41.98 
 
 
549 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  42.55 
 
 
567 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 
559 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  41.52 
 
 
579 aa  421  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 
566 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.02 
 
 
569 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.72 
 
 
569 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.58 
 
 
554 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.02 
 
 
569 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.47 
 
 
560 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 
601 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  40.07 
 
 
560 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.39 
 
 
560 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.22 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 
559 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 
563 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.04 
 
 
581 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.79 
 
 
563 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 
562 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  40.96 
 
 
604 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 
567 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 
569 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.16 
 
 
568 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.61 
 
 
581 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
584 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
557 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
572 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.57 
 
 
557 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
584 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  39.64 
 
 
584 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 
552 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  41.76 
 
 
551 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.03 
 
 
557 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
584 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
584 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.03 
 
 
557 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.11 
 
 
561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.11 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.21 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.93 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.21 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  41.91 
 
 
568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.07 
 
 
567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 
584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 
557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  39.93 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 
565 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.03 
 
 
557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.24 
 
 
557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.97 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>