More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1435 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  83.42 
 
 
579 aa  1032    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  82.93 
 
 
577 aa  1017    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
577 aa  1182    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  42.76 
 
 
559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  43.46 
 
 
561 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.51 
 
 
561 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.37 
 
 
582 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  41.28 
 
 
564 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.2 
 
 
582 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  42.81 
 
 
566 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.51 
 
 
563 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.76 
 
 
561 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.51 
 
 
563 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.51 
 
 
563 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.33 
 
 
561 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.51 
 
 
563 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 
557 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.86 
 
 
561 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.81 
 
 
561 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
577 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  41.5 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41 
 
 
585 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  40.76 
 
 
590 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  42.04 
 
 
549 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 
584 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 
591 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  41.22 
 
 
569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
565 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 
577 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
584 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 
554 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
549 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 
585 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.28 
 
 
554 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 
578 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
572 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.28 
 
 
581 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 
558 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
539 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 
564 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 
583 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 
567 aa  360  5e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.98 
 
 
560 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 
594 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 
571 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
543 aa  353  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.56 
 
 
581 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.36 
 
 
559 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
559 aa  350  4e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.54 
 
 
566 aa  350  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
588 aa  349  7e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 
544 aa  349  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 
558 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.86 
 
 
563 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
551 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 
536 aa  347  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  40.46 
 
 
515 aa  346  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1866  long-chain fatty acid-CoA ligase (AMP-binding)  33.8 
 
 
594 aa  345  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
567 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
564 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.06 
 
 
557 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 
525 aa  343  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 
514 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
584 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 
561 aa  343  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.68 
 
 
567 aa  343  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.68 
 
 
557 aa  342  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.21 
 
 
566 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 
553 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.68 
 
 
557 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
560 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
561 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 
559 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.04 
 
 
557 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2263  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 
558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.694237  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1606  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 
558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.016837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.65 
 
 
568 aa  340  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.78 
 
 
557 aa  340  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3122  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
573 aa  340  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.72 
 
 
557 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.72 
 
 
557 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
566 aa  339  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.37 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.54 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.75 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.43 
 
 
560 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 
647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
549 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.32 
 
 
572 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
573 aa  337  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.590511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
552 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
508 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.92 
 
 
560 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.37 
 
 
561 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
559 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 
584 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.57 
 
 
557 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 
584 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>