More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0330 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
559 aa  1147    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.75 
 
 
559 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.47 
 
 
560 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.45 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 
566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.31 
 
 
571 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2341  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 
560 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.59 
 
 
568 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.06 
 
 
568 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.99 
 
 
565 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.7 
 
 
568 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.99 
 
 
563 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.22 
 
 
569 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6849  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.5 
 
 
586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.86 
 
 
567 aa  518  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.52 
 
 
564 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.63 
 
 
564 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.07 
 
 
575 aa  505  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.17 
 
 
551 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.15 
 
 
565 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.75 
 
 
559 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.9 
 
 
562 aa  482  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  42.65 
 
 
563 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4155  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.65 
 
 
584 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 
559 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5508  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.69 
 
 
675 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 
566 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
563 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 
563 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
561 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
557 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 
561 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 
582 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 
561 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.17 
 
 
561 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 
582 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 
563 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 
563 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 
591 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 
561 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
590 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  37.39 
 
 
561 aa  359  9e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
577 aa  350  4e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 
551 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
561 aa  340  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
579 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 
549 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
577 aa  335  9e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
565 aa  333  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
578 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
552 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
569 aa  326  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
521 aa  325  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
555 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
532 aa  322  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
539 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 
558 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
583 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 
564 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  33.22 
 
 
560 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
567 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
584 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.68 
 
 
555 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
543 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  33.81 
 
 
561 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 
561 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 
561 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 
561 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 
561 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  33.81 
 
 
561 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
536 aa  303  7.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2263  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
558 aa  302  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.694237  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  33.21 
 
 
558 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 
561 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 
584 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.74 
 
 
557 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
583 aa  301  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
561 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 
572 aa  300  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 
561 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 
561 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 
561 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 
561 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.97 
 
 
557 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.97 
 
 
557 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 
585 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
662 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.69 
 
 
563 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
573 aa  297  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
535 aa  297  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0229  acyl-CoA synthetase  35.33 
 
 
571 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
551 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
537 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>