More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0337 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 577 aa  1191    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 566 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 		 557 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.78 
 
 		 549 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.65 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.28 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.31 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.28 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 		 582 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.61 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 		 582 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.21 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.84 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 		 577 aa  420  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 		 584 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 		 565 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  40.1 
 
 		 591 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 		 590 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 564 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 		 549 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 		 564 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.04 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  39.9 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.9 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 584 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.39 
 
 		 581 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 559 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  40.35 
 
 		 543 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 584 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 579 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.12 
 
 		 560 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.19 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 		 561 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 584 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 585 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.74 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 559 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 		 566 aa  365  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 566 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 557 aa  364  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 		 572 aa  363  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.14 
 
 		 557 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 		 554 aa  363  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 571 aa  363  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.39 
 
 		 557 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.66 
 
 		 569 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 		 569 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  38.19 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 583 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.83 
 
 		 569 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.19 
 
 		 583 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.1 
 
 		 557 aa  362  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.19 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.62 
 
 		 557 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.19 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  38.19 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.19 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.54 
 
 		 561 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.93 
 
 		 581 aa  361  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.9 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.18 
 
 		 566 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.02 
 
 		 561 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 579 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.49 
 
 		 569 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.58 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.58 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.33 
 
 		 566 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.58 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.53 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.58 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.93 
 
 		 557 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.72 
 
 		 557 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>