More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0889 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  85.64 
 
 		 558 aa  962    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 560 aa  1130    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  60.58 
 
 		 575 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  43.86 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  43.77 
 
 		 566 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  45.06 
 
 		 551 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  43.23 
 
 		 591 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  43.06 
 
 		 590 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.58 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.58 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.58 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 563 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 563 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 582 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.27 
 
 		 561 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.5 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.29 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 		 565 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  45.49 
 
 		 549 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 561 aa  445  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  42.7 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 583 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 		 585 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  42.01 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 584 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 569 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 543 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.71 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 583 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.08 
 
 		 583 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 564 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  37.39 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 591 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  39.82 
 
 		 560 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.95 
 
 		 562 aa  360  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 577 aa  359  9e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.34 
 
 		 562 aa  356  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 554 aa  355  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 		 549 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 566 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  34.81 
 
 		 569 aa  349  6e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  34.64 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.81 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 571 aa  346  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.83 
 
 		 562 aa  346  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 577 aa  340  4e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 		 565 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 562 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.47 
 
 		 512 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.02 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 562 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 		 557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 579 aa  336  7e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 565 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 		 557 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.94 
 
 		 565 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.13 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 510 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.95 
 
 		 510 aa  331  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 553 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.76 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.76 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.89 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.76 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 565 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.76 
 
 		 510 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 510 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 		 563 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 563 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.94 
 
 		 563 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 		 565 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.13 
 
 		 557 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.13 
 
 		 557 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 		 510 aa  329  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 569 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 		 562 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 		 572 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.13 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.89 
 
 		 561 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  34.89 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 563 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.89 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  34.89 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.89 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.89 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 583 aa  326  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>