More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0839 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  84.72 
 
 		 579 aa  1040    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 577 aa  1180    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  82.93 
 
 		 577 aa  1017    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.58 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.58 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.98 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 		 582 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 582 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  41.84 
 
 		 564 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.27 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 		 549 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.24 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  42.53 
 
 		 566 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 584 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  42.66 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  40.99 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.57 
 
 		 585 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  41.89 
 
 		 551 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 		 573 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  40.63 
 
 		 565 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 		 583 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 		 590 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 591 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 584 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 564 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 		 554 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 		 581 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 583 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 572 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 543 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 571 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.04 
 
 		 566 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.28 
 
 		 581 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 567 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 566 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 544 aa  356  5e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 588 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 549 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 594 aa  355  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.93 
 
 		 559 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 560 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3122  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 573 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.25 
 
 		 558 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 553 aa  349  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 551 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1866  long-chain fatty acid-CoA ligase (AMP-binding)  35.41 
 
 		 594 aa  348  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 583 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 583 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  36.98 
 
 		 561 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 		 561 aa  347  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  36.98 
 
 		 561 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 573 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.590511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.37 
 
 		 557 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  39.58 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 		 557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.81 
 
 		 561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 		 567 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 584 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 584 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 586 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 		 557 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 		 557 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 584 aa  343  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 527 aa  343  7e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 		 557 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 		 557 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.85 
 
 		 557 aa  342  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1276  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.011036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 584 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.17 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1035  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.526739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0305097  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.99 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1782  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 584 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>