More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0904 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.48 
 
 
568 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.97 
 
 
565 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
559 aa  1149    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.96 
 
 
568 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.61 
 
 
571 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.84 
 
 
560 aa  726    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.63 
 
 
566 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2341  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.83 
 
 
560 aa  720    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.03 
 
 
553 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.61 
 
 
568 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  53.75 
 
 
559 aa  630  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.45 
 
 
563 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.86 
 
 
569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.36 
 
 
551 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.52 
 
 
564 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6849  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.94 
 
 
586 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.71 
 
 
565 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.65 
 
 
567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.26 
 
 
575 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.15 
 
 
562 aa  559  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.05 
 
 
564 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  53.22 
 
 
563 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4155  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.45 
 
 
584 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5508  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  44.68 
 
 
675 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 
561 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 
561 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.57 
 
 
563 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 
561 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
566 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.57 
 
 
563 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.39 
 
 
563 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.39 
 
 
561 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.57 
 
 
563 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 
582 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
561 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
557 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.57 
 
 
582 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
532 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 
561 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 
591 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
559 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 
577 aa  353  4e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 
590 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
551 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  41.91 
 
 
549 aa  351  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 
577 aa  350  3e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 
553 aa  350  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 
539 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
579 aa  344  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 
535 aa  340  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 
569 aa  339  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 
577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 
577 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
565 aa  332  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
552 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 
551 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 
537 aa  327  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 
544 aa  326  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
536 aa  325  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 
583 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 
555 aa  321  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
564 aa  317  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
584 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
585 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
527 aa  313  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
562 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354972  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.4 
 
 
555 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 
572 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3362  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0064  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  35.6 
 
 
601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 
521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 
572 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
558 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 
567 aa  306  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 
564 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
584 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 
523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 
561 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
578 aa  303  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.93 
 
 
565 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  35.48 
 
 
561 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
583 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 
561 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  35.48 
 
 
561 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 
561 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.26 
 
 
561 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 
583 aa  302  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 
561 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.93 
 
 
565 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 
562 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 
561 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 
561 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 
561 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 
561 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.93 
 
 
565 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 
549 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>