More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2902 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  65.58 
 
 
536 aa  695    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
523 aa  1064    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  65.9 
 
 
527 aa  681    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0967  AMP-dependent synthetase and ligase  43.99 
 
 
525 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 
561 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.27 
 
 
563 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.27 
 
 
563 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.27 
 
 
582 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3407  AMP-dependent synthetase and ligase  44.19 
 
 
526 aa  359  7e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.108294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  39.03 
 
 
557 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 
569 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.81 
 
 
561 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.37 
 
 
514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.63 
 
 
582 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.9 
 
 
561 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.08 
 
 
563 aa  356  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
559 aa  356  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.82 
 
 
561 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
539 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.63 
 
 
561 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.72 
 
 
563 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
512 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
551 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 
506 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 
521 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.03 
 
 
561 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
590 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 
566 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.29 
 
 
510 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 
549 aa  347  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 
591 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 
512 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
499 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 
510 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 
577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 
510 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 
510 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 
501 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 
510 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 
510 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 
510 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 
510 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.45 
 
 
510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 
565 aa  339  5.9999999999999996e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 
564 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.41 
 
 
516 aa  336  7e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  41.25 
 
 
506 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
577 aa  333  3e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 
564 aa  332  8e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.82 
 
 
515 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 
543 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 
573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.47 
 
 
585 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
500 aa  329  9e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 
508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  38.31 
 
 
508 aa  326  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
577 aa  325  9e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 
505 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 
583 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 
518 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.3 
 
 
510 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
585 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 
662 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 
513 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
510 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 
519 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 
566 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 
584 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 
520 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
555 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 
559 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
525 aa  316  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 
527 aa  316  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
583 aa  316  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 
521 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
549 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
511 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 
571 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
525 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 
569 aa  309  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.92 
 
 
559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 
577 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 
563 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 
564 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  35.69 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.63 
 
 
567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 
544 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.97 
 
 
553 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 
522 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.9 
 
 
557 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.39 
 
 
568 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.63 
 
 
563 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 
552 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.96 
 
 
562 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
572 aa  299  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>