More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 551 aa  1140    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.36 
 
 		 559 aa  585  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.1 
 
 		 560 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.19 
 
 		 568 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.27 
 
 		 568 aa  551  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.84 
 
 		 568 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.44 
 
 		 553 aa  548  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49 
 
 		 563 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.01 
 
 		 565 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.37 
 
 		 566 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2341  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.56 
 
 		 560 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.83 
 
 		 571 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.91 
 
 		 565 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.4 
 
 		 564 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.73 
 
 		 569 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.5 
 
 		 567 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6849  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.85 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 		 559 aa  498  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.96 
 
 		 559 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  47.88 
 
 		 563 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48 
 
 		 575 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.45 
 
 		 564 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.22 
 
 		 562 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4155  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.28 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5508  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  43.3 
 
 		 675 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 559 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 		 566 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 563 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.17 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.22 
 
 		 561 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 582 aa  346  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.72 
 
 		 563 aa  346  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.17 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 563 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 563 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 582 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 		 552 aa  340  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.09 
 
 		 561 aa  332  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 591 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 551 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 583 aa  320  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 590 aa  319  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 561 aa  316  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 532 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 577 aa  309  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.06 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 535 aa  306  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 539 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 512 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 577 aa  300  4e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 577 aa  299  7e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 537 aa  299  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3362  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 562 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 562 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 521 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 569 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 564 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 548 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 551 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4068  acyl-CoA synthetase  35.1 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0302705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0064  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  36.23 
 
 		 601 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 584 aa  283  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.3 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 536 aa  279  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 		 572 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 549 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 512 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 585 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 662 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 523 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.51 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 577 aa  270  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 551 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0229  acyl-CoA synthetase  32.97 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0967  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.56 
 
 		 573 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 543 aa  266  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.65 
 
 		 568 aa  266  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.7 
 
 		 585 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>