More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2699 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1066    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.61 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  47.78 
 
 		 527 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  47.77 
 
 		 508 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  48.06 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  47.29 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  47.12 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  46.54 
 
 		 511 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  45.77 
 
 		 521 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  45.77 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  47.09 
 
 		 511 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  45.07 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  44.91 
 
 		 519 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  42.77 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.64 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.25 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  41.17 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  42.11 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.23 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  41.63 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.08 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 490 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  40.76 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.69 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.69 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.85 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.38 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.04 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 662 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 506 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 549 aa  356  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 539 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 583 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 525 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 509 aa  350  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 495 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 563 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 582 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 563 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 561 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  38.61 
 
 		 508 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.24 
 
 		 561 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.22 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 551 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 582 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 564 aa  337  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 569 aa  336  7.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 584 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 566 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  36.14 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 544 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 508 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.59 
 
 		 585 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 557 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 585 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 520 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0411  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 		 513 aa  317  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 527 aa  316  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.75 
 
 		 503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  35.6 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 564 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 573 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  35.41 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  35.41 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  35.41 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 590 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 		 555 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 511 aa  302  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.48 
 
 		 549 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  35.1 
 
 		 549 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 536 aa  299  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 506 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  35.31 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>