More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2975 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
551 aa  1142    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  47.44 
 
 
532 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  47.47 
 
 
553 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  48.13 
 
 
537 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  46.43 
 
 
535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  43.83 
 
 
562 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3362  AMP-dependent synthetase and ligase  44.17 
 
 
562 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0064  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  44.06 
 
 
601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2035  AMP-dependent synthetase and ligase  42.16 
 
 
527 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2341  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.99 
 
 
560 aa  349  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.79 
 
 
560 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.61 
 
 
559 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 
553 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 
566 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0229  acyl-CoA synthetase  36.78 
 
 
571 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4068  acyl-CoA synthetase  35.7 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0302705  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 
559 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1635  acyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 
563 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 
582 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.65 
 
 
569 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 
561 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
563 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
582 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.17 
 
 
571 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
563 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
563 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.2 
 
 
561 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.39 
 
 
559 aa  309  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2996  acyl-CoA synthetase  33.87 
 
 
592 aa  306  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.353714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.11 
 
 
568 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2412  acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 
567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 
561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 
561 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 
565 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 
566 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.05 
 
 
563 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.11 
 
 
568 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 
565 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
551 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.95 
 
 
564 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.93 
 
 
568 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3437  acyl-CoA synthetase  34 
 
 
580 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596477  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6849  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 
586 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
577 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.64 
 
 
575 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.66 
 
 
551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381221  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
563 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.56 
 
 
567 aa  280  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
579 aa  278  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
577 aa  276  7e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
552 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 
583 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 
564 aa  273  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
584 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
562 aa  267  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2866  acyl-CoA synthetase  34.41 
 
 
569 aa  267  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
561 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 
514 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4155  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.64 
 
 
584 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
549 aa  263  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
525 aa  263  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
520 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
569 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 
577 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 
510 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 
510 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
559 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 
510 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 
510 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 
510 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 
510 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.6 
 
 
510 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.21 
 
 
512 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.08 
 
 
561 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.08 
 
 
561 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
544 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.08 
 
 
561 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.08 
 
 
561 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.87 
 
 
510 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.41 
 
 
510 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.9 
 
 
561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.73 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 
521 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
549 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
561 aa  253  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 
564 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
518 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 
569 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
578 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
585 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 
512 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
506 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.96 
 
 
555 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.79 
 
 
572 aa  249  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 
564 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
555 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>