More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2035 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2035  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
527 aa  1076    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  47.45 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  46.86 
 
 
532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  46.28 
 
 
562 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3362  AMP-dependent synthetase and ligase  45.55 
 
 
562 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0064  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  45.74 
 
 
601 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  44.42 
 
 
535 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 
551 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 
537 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
577 aa  318  2e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2866  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
569 aa  316  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 
561 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
563 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
582 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
563 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
563 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
582 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 
561 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 
561 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.33 
 
 
561 aa  309  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0229  acyl-CoA synthetase  37.13 
 
 
571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 
579 aa  306  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2996  acyl-CoA synthetase  38.33 
 
 
592 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.353714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4068  acyl-CoA synthetase  37.41 
 
 
579 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0302705  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 
566 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.19 
 
 
559 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1635  acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 
571 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
552 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
557 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
527 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.05 
 
 
513 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3437  acyl-CoA synthetase  36.33 
 
 
580 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 
551 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 
559 aa  289  8e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
584 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.12 
 
 
562 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2341  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 
560 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.88 
 
 
560 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.98 
 
 
565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 
565 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 
565 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
512 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
553 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
583 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 
565 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
521 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 
512 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 
563 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 
562 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 
565 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 
562 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
539 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2412  acyl-CoA synthetase  35.06 
 
 
567 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 
555 aa  279  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 
562 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 
562 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.58 
 
 
503 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 
564 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.86 
 
 
558 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 
514 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 
577 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 
561 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 
561 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 
561 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.46 
 
 
565 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 
561 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 
563 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.54 
 
 
561 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6849  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 
586 aa  276  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.78 
 
 
568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 
566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
572 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 
499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 
506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 
569 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 
565 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  34.11 
 
 
550 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  33.53 
 
 
514 aa  273  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 
560 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.03 
 
 
581 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
525 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.65 
 
 
555 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 
525 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 
563 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 
567 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
508 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 
583 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.47 
 
 
563 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 
573 aa  270  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.94 
 
 
568 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  37.08 
 
 
508 aa  269  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>