More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  54.8 
 
 
561 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  54.8 
 
 
583 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  82.74 
 
 
565 aa  994    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.85 
 
 
562 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.98 
 
 
561 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.8 
 
 
561 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.85 
 
 
562 aa  715    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  80.07 
 
 
563 aa  966    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.89 
 
 
562 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  54.8 
 
 
561 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  78.65 
 
 
563 aa  961    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.96 
 
 
562 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.98 
 
 
561 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  82.03 
 
 
565 aa  987    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.94 
 
 
573 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  82.92 
 
 
565 aa  999    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.61 
 
 
562 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.8 
 
 
561 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.8 
 
 
561 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.8 
 
 
561 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.75 
 
 
562 aa  711    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.5 
 
 
562 aa  709    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  82.92 
 
 
565 aa  996    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.45 
 
 
561 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1824  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.43 
 
 
562 aa  705    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.919675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.98 
 
 
561 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.67 
 
 
563 aa  691    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.64 
 
 
562 aa  1161    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.45 
 
 
572 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.8 
 
 
583 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.41 
 
 
562 aa  1024    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.18 
 
 
558 aa  734    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.98 
 
 
561 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.96 
 
 
562 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
562 aa  1164    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.8 
 
 
561 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.39 
 
 
562 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  72.88 
 
 
567 aa  852    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.58356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1573  AMP-dependent synthetase and ligase  58.01 
 
 
565 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.750238  hitchhiker  0.00328561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  82.74 
 
 
565 aa  996    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.22 
 
 
562 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.22 
 
 
577 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.22 
 
 
562 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  52.42 
 
 
567 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.88 
 
 
572 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  54 
 
 
599 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  54.17 
 
 
553 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.18 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  53.27 
 
 
586 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.89 
 
 
557 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.09 
 
 
566 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  52.79 
 
 
567 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.43 
 
 
563 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  52.93 
 
 
584 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.79 
 
 
563 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  52.93 
 
 
584 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.91 
 
 
557 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.91 
 
 
557 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  51.34 
 
 
569 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  52.93 
 
 
584 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.73 
 
 
557 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.24 
 
 
558 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.9 
 
 
557 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.55 
 
 
557 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  52.93 
 
 
584 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  53.11 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.61 
 
 
557 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.55 
 
 
557 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  53.11 
 
 
584 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.18 
 
 
557 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  52.62 
 
 
573 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000307884  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  54.45 
 
 
560 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.62 
 
 
572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  52.84 
 
 
572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.61 
 
 
557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.81 
 
 
557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.07 
 
 
555 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  52.58 
 
 
604 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  52.58 
 
 
601 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.07 
 
 
557 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.25 
 
 
557 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1782  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.26 
 
 
590 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1276  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.26 
 
 
590 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.011036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1957  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.26 
 
 
590 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000391168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.26 
 
 
590 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0305097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1764  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.26 
 
 
590 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1035  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.26 
 
 
590 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.526739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1803  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.26 
 
 
590 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  51.89 
 
 
552 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  51.09 
 
 
569 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  51.09 
 
 
569 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  52.61 
 
 
566 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  52.79 
 
 
562 aa  594  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1667  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.21 
 
 
573 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  51.52 
 
 
559 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.78 
 
 
560 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2529  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.91 
 
 
590 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.84 
 
 
563 aa  591  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.95 
 
 
560 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  53.16 
 
 
647 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>