More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1573 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.83 
 
 		 565 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.9 
 
 		 563 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.17 
 
 		 563 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1573  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 565 aa  1169    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.750238  hitchhiker  0.00328561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.67 
 
 		 565 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.41 
 
 		 565 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.64 
 
 		 565 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.41 
 
 		 565 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.77 
 
 		 563 aa  664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.01 
 
 		 562 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.75 
 
 		 562 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.45 
 
 		 558 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.01 
 
 		 562 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.3 
 
 		 562 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1824  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.94 
 
 		 562 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.919675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.2 
 
 		 562 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.76 
 
 		 562 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.92 
 
 		 562 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.92 
 
 		 562 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.23 
 
 		 562 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.92 
 
 		 562 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.73 
 
 		 567 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.58356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.2 
 
 		 562 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.56 
 
 		 562 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.64 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.83 
 
 		 572 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.73 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  52.26 
 
 		 572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.91 
 
 		 572 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  50.18 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  49.12 
 
 		 583 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.12 
 
 		 583 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  50.18 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.37 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  49.36 
 
 		 569 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.83 
 
 		 557 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 563 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.77 
 
 		 573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.65 
 
 		 563 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 		 567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 561 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 558 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.91 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.28 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.28 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 572 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 562 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.28 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 562 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1886  pseudouridine synthase, Rsu  51.59 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 577 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.27 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.54 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2897  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.38 
 
 		 531 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00596817  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  50.17 
 
 		 573 aa  558  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000307884  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3695  AMP-dependent synthetase and ligase  50.75 
 
 		 534 aa  558  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.43 
 
 		 555 aa  558  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  50.46 
 
 		 537 aa  551  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3322  AMP-dependent synthetase and ligase  51.94 
 
 		 532 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000803182  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0735  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.27 
 
 		 560 aa  551  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1189  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.27 
 
 		 551 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1667  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.05 
 
 		 573 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  48.26 
 
 		 567 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  49.26 
 
 		 560 aa  551  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  48.89 
 
 		 532 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  48.07 
 
 		 553 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.53 
 
 		 554 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.35 
 
 		 581 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  50.47 
 
 		 534 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  47.8 
 
 		 569 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 		 534 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000448213  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.99 
 
 		 563 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3334  AMP-dependent synthetase and ligase  49.35 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1058  AMP-dependent synthetase and ligase  49.53 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.599602  normal  0.879487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2934  AMP-dependent synthetase and ligase  47.75 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 		 534 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  47.44 
 
 		 569 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.07 
 
 		 581 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0956  AMP-dependent synthetase and ligase  49.35 
 
 		 533 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.45 
 
 		 563 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3084  AMP-dependent synthetase and ligase  49.54 
 
 		 531 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  49.35 
 
 		 533 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2263  AMP-dependent synthetase and ligase  47.33 
 
 		 558 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.694237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1606  AMP-dependent synthetase and ligase  47.6 
 
 		 558 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.016837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.89 
 
 		 566 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  46.49 
 
 		 553 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>