More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1371 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  64.84 
 
 		 573 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  56.91 
 
 		 598 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  65.25 
 
 		 614 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  62.88 
 
 		 629 aa  747    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  63.24 
 
 		 624 aa  746    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  64.9 
 
 		 608 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  100 
 
 		 571 aa  1179    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  63.32 
 
 		 628 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  65.33 
 
 		 613 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  65.54 
 
 		 608 aa  768    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  65.32 
 
 		 564 aa  751    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  65.22 
 
 		 585 aa  747    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  66.22 
 
 		 608 aa  767    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  61.24 
 
 		 564 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  58.9 
 
 		 554 aa  662    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  63.38 
 
 		 563 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  65.73 
 
 		 574 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  63.58 
 
 		 624 aa  751    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  47.77 
 
 		 542 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  46.5 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  46.34 
 
 		 546 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  47.7 
 
 		 545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  46.49 
 
 		 544 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  46.36 
 
 		 564 aa  490  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  41.3 
 
 		 564 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  43.8 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  43.26 
 
 		 552 aa  428  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  43.48 
 
 		 548 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  43.23 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  38.72 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  37.21 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  31.48 
 
 		 581 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 927 aa  207  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.93 
 
 		 922 aa  206  8e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 875 aa  183  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.66 
 
 		 922 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 861 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.05 
 
 		 899 aa  173  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.98 
 
 		 978 aa  171  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 915 aa  164  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 		 525 aa  140  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.52 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  24.37 
 
 		 983 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.81 
 
 		 579 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 553 aa  106  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 536 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  25.55 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  24.58 
 
 		 552 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  25.1 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  25.15 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  25.2 
 
 		 513 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 555 aa  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 		 525 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.21 
 
 		 519 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  23.24 
 
 		 555 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.55 
 
 		 570 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  22.88 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  23.35 
 
 		 1317 aa  100  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.43 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  25.11 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.43 
 
 		 556 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  23.86 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  23.86 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.43 
 
 		 556 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  23.86 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  22.72 
 
 		 5596 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_904  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  24.01 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000599139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  22.98 
 
 		 511 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  22.54 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  24.21 
 
 		 518 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 		 662 aa  97.8  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 515 aa  97.8  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  24.08 
 
 		 539 aa  97.8  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  24.63 
 
 		 522 aa  97.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 		 577 aa  97.4  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 		 495 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  24.26 
 
 		 523 aa  97.4  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 		 508 aa  97.1  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  24.01 
 
 		 525 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  24.6 
 
 		 529 aa  97.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  24.05 
 
 		 532 aa  97.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 520 aa  97.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 		 499 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  24.47 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 		 519 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  23.36 
 
 		 590 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  25.58 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2202  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  28.14 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  24.01 
 
 		 520 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0916  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 505 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0236685  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  26.36 
 
 		 3224 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  24.34 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  22.71 
 
 		 577 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  23.77 
 
 		 2571 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 525 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>