More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0943 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  77.69 
 
 
509 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
511 aa  1018    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  47.58 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  48.66 
 
 
520 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  49.03 
 
 
523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.03 
 
 
526 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.61 
 
 
525 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.45 
 
 
525 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.82 
 
 
525 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.83 
 
 
526 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.96 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.21 
 
 
525 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.45 
 
 
526 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.92 
 
 
519 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.23 
 
 
530 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.53 
 
 
527 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  44.77 
 
 
521 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  40.86 
 
 
509 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  42.6 
 
 
520 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  42.89 
 
 
541 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 
522 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 
517 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  41.63 
 
 
517 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  41.63 
 
 
517 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 
522 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 
522 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  43.08 
 
 
514 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
515 aa  349  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  43 
 
 
515 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  43 
 
 
515 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
520 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 
518 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.84 
 
 
503 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  41.25 
 
 
517 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.56 
 
 
565 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 
524 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 
530 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
519 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
518 aa  343  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  41.26 
 
 
520 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
512 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 
518 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 
526 aa  333  6e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  39.8 
 
 
517 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 
518 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 
519 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 
518 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 
506 aa  326  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 
518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
518 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.5 
 
 
529 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 
516 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 
517 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
517 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
520 aa  313  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 
501 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 
520 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 
518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 
531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  35.32 
 
 
520 aa  307  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 
515 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
530 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 
508 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
517 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.31 
 
 
556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.31 
 
 
556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 
517 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.31 
 
 
556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 
500 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  40.8 
 
 
526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 
525 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  38.22 
 
 
516 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.92 
 
 
565 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 
519 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
509 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 
508 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  39.57 
 
 
521 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 
502 aa  300  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  37.79 
 
 
517 aa  299  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
512 aa  299  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
515 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 
504 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  37.68 
 
 
514 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
530 aa  296  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
535 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 
662 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
508 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
522 aa  293  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  33.2 
 
 
499 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  36.88 
 
 
528 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
521 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 
506 aa  292  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>