More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1715 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  63.74 
 
 		 628 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  59.67 
 
 		 598 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  66.44 
 
 		 614 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  71.65 
 
 		 585 aa  817    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  65.52 
 
 		 608 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  100 
 
 		 563 aa  1172    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  63.38 
 
 		 571 aa  727    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  63.84 
 
 		 624 aa  747    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  71.38 
 
 		 574 aa  815    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  63.13 
 
 		 629 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  65.82 
 
 		 613 aa  762    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  66.04 
 
 		 608 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  65.01 
 
 		 564 aa  737    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  66.38 
 
 		 608 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  62.68 
 
 		 564 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  63.39 
 
 		 554 aa  709    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  69.26 
 
 		 573 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  63.5 
 
 		 624 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  51.64 
 
 		 542 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  52.18 
 
 		 545 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  51.55 
 
 		 544 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  48.83 
 
 		 546 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  48.65 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  45.31 
 
 		 564 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  46.03 
 
 		 564 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  44.9 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  44.32 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  44.27 
 
 		 548 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  44.93 
 
 		 548 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  41.56 
 
 		 564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  37.66 
 
 		 555 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  32.51 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.18 
 
 		 922 aa  210  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 927 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.54 
 
 		 899 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 875 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.34 
 
 		 922 aa  190  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.63 
 
 		 978 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 861 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 915 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.11 
 
 		 553 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  26.3 
 
 		 2571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  26.3 
 
 		 2571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 564 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  23.88 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.37 
 
 		 560 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  25.58 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  23.02 
 
 		 2031 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  25.05 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  27.68 
 
 		 6274 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  27.68 
 
 		 6272 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 571 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  24.77 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  24.39 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  27.73 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  26.11 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.13 
 
 		 513 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 		 519 aa  104  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 583 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 507 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  25.49 
 
 		 511 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  27.45 
 
 		 6271 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  24.56 
 
 		 3224 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 527 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  25.22 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  26 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  25.32 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  24.9 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  25.22 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  25.49 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  22.85 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  26.29 
 
 		 545 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  24.94 
 
 		 5328 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 564 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.44 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 577 aa  100  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  24.31 
 
 		 2448 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 508 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.39 
 
 		 490 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  24.41 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  26.1 
 
 		 529 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  25.45 
 
 		 4383 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 515 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  24.1 
 
 		 552 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  25.1 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 515 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  26.97 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  25.88 
 
 		 549 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  24.24 
 
 		 564 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 536 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 		 577 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  25.45 
 
 		 532 aa  98.6  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.9 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>