More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1867 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 507 aa  1019    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 		 502 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  41.05 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  42.11 
 
 		 530 aa  319  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  37.66 
 
 		 504 aa  319  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  39.08 
 
 		 512 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 		 504 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  39.24 
 
 		 526 aa  317  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  37.76 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  38 
 
 		 519 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  38 
 
 		 519 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  38.53 
 
 		 506 aa  310  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  37.74 
 
 		 506 aa  310  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  39.22 
 
 		 503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  39.3 
 
 		 507 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  37.68 
 
 		 510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  37.47 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  39.25 
 
 		 504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  38.59 
 
 		 511 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  37.78 
 
 		 511 aa  303  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  39.12 
 
 		 507 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  37.97 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  37.58 
 
 		 517 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  37.5 
 
 		 504 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  37.55 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  37.87 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  37.7 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  37.55 
 
 		 509 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  37.71 
 
 		 518 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  34.84 
 
 		 507 aa  296  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  38.12 
 
 		 504 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  39.96 
 
 		 510 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  38.95 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  36.86 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 520 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  37.55 
 
 		 506 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  35.43 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  38.56 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 525 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 520 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  37.06 
 
 		 504 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 492 aa  289  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.15 
 
 		 583 aa  289  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.43 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  36.83 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 512 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  37.3 
 
 		 510 aa  286  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  38.6 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  44.35 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  37.3 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.38 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  37.4 
 
 		 517 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 		 512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  37.22 
 
 		 500 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.29 
 
 		 513 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.2 
 
 		 514 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  37.89 
 
 		 501 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 539 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  37.42 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 501 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  37.47 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  36.57 
 
 		 547 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 		 561 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.21 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.08 
 
 		 557 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 584 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 510 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 509 aa  276  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 561 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 557 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  36.33 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 500 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 		 563 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 564 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 563 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 		 525 aa  273  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 563 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 5154 aa  272  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 563 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.82 
 
 		 568 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 502 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 493 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 		 562 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 508 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 562 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>