More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0519 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0519  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 564 aa  1153    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  32.37 
 
 		 550 aa  280  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  32.12 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  32.85 
 
 		 568 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  32.04 
 
 		 547 aa  273  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 		 549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  31.43 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  34.41 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 544 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.96 
 
 		 552 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 572 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 553 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.98 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  31.25 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  30.68 
 
 		 550 aa  264  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  35 
 
 		 570 aa  264  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  35.31 
 
 		 552 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  31.52 
 
 		 548 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 570 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  31.94 
 
 		 549 aa  263  8e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  35.23 
 
 		 574 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  31.38 
 
 		 549 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  32.57 
 
 		 550 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  30.58 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  35.23 
 
 		 570 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 570 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 571 aa  261  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  31.12 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 570 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 570 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  32.61 
 
 		 570 aa  260  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 562 aa  259  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  33.69 
 
 		 578 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  31.99 
 
 		 560 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 533 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  33.04 
 
 		 573 aa  257  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  31.75 
 
 		 550 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 630 aa  256  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  31.37 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 542 aa  254  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 554 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  31.47 
 
 		 560 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.3 
 
 		 579 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  33.03 
 
 		 562 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  33.66 
 
 		 568 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  32.66 
 
 		 575 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.79 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 544 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  32.67 
 
 		 546 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  32.66 
 
 		 575 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 843 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  32.67 
 
 		 546 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  33.66 
 
 		 549 aa  250  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 566 aa  249  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  32.73 
 
 		 557 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 575 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  32.89 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 576 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 575 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 566 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  33.47 
 
 		 543 aa  246  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  32.88 
 
 		 565 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 564 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  32.23 
 
 		 575 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  31.77 
 
 		 605 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  32.55 
 
 		 557 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 564 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  33.66 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  30.63 
 
 		 579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  29.1 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  31.99 
 
 		 564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  33.47 
 
 		 564 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  32.03 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  33.84 
 
 		 546 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 561 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 596 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 558 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.79 
 
 		 576 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 570 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  33.13 
 
 		 547 aa  243  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 576 aa  243  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 577 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  31.03 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>