More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3209 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  56.76 
 
 		 562 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  55.54 
 
 		 566 aa  659    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  56.64 
 
 		 576 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  63.08 
 
 		 545 aa  684    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  55.86 
 
 		 557 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  56.46 
 
 		 578 aa  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  56.64 
 
 		 576 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  99.08 
 
 		 546 aa  1126    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  57.04 
 
 		 575 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  56.64 
 
 		 576 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  56.64 
 
 		 570 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  56.38 
 
 		 564 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  61.97 
 
 		 549 aa  697    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  56.33 
 
 		 575 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 546 aa  1133    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  56.55 
 
 		 561 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  58.58 
 
 		 572 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  91.03 
 
 		 546 aa  1060    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  55.5 
 
 		 576 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  58.17 
 
 		 562 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  56.4 
 
 		 557 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  56.94 
 
 		 571 aa  667    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  56.81 
 
 		 601 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  58.36 
 
 		 577 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  55.03 
 
 		 564 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  55.99 
 
 		 562 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  56.22 
 
 		 557 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  60.19 
 
 		 538 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  58.84 
 
 		 565 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  59.85 
 
 		 547 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  56.64 
 
 		 576 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  61.12 
 
 		 540 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  64.22 
 
 		 552 aa  738    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  57.52 
 
 		 566 aa  667    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  56.64 
 
 		 576 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  64.04 
 
 		 551 aa  734    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  58.27 
 
 		 541 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  57.27 
 
 		 575 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  61.12 
 
 		 540 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  57.09 
 
 		 564 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  57.82 
 
 		 550 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  55.89 
 
 		 566 aa  668    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  58.24 
 
 		 576 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  58.05 
 
 		 542 aa  693    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  64.27 
 
 		 544 aa  730    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  59.6 
 
 		 560 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  63.06 
 
 		 530 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  57.84 
 
 		 539 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  60.59 
 
 		 542 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  61.12 
 
 		 540 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  81.14 
 
 		 546 aa  945    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  59.74 
 
 		 538 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  59.07 
 
 		 1043 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  55.88 
 
 		 564 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  60.59 
 
 		 550 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  57.62 
 
 		 577 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  56.46 
 
 		 578 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  55.36 
 
 		 560 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  55.32 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  56.46 
 
 		 576 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  56.25 
 
 		 576 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  56.45 
 
 		 579 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  57.59 
 
 		 552 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  55.26 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  54.99 
 
 		 565 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  56.83 
 
 		 576 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  56.15 
 
 		 575 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  55.97 
 
 		 575 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  55.97 
 
 		 575 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  56.15 
 
 		 575 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  50.58 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  55.71 
 
 		 576 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  54.59 
 
 		 560 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  55.47 
 
 		 552 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  54.16 
 
 		 549 aa  618  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  53.81 
 
 		 596 aa  618  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  54.95 
 
 		 560 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  55.11 
 
 		 560 aa  618  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  54.64 
 
 		 576 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  55.27 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  53.45 
 
 		 584 aa  616  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  53.96 
 
 		 558 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  55.86 
 
 		 596 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  54.68 
 
 		 558 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  54.58 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  54.46 
 
 		 549 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  53.1 
 
 		 602 aa  611  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  55.6 
 
 		 539 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  53.01 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  54.01 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  54.14 
 
 		 552 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  55.31 
 
 		 543 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  52.66 
 
 		 571 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  52.57 
 
 		 579 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  52.85 
 
 		 544 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  51.07 
 
 		 554 aa  588  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  55.25 
 
 		 518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0354  AMP-dependent synthetase and ligase  51.9 
 
 		 576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  50.63 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  51 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>