More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0663 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  59.59 
 
 
549 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  61.07 
 
 
552 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  74.82 
 
 
549 aa  865    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  70.46 
 
 
552 aa  839    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  54.97 
 
 
554 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  59.85 
 
 
560 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  57.68 
 
 
552 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  58.69 
 
 
549 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  58.18 
 
 
550 aa  657    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  57.71 
 
 
544 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  59.52 
 
 
549 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  62.78 
 
 
563 aa  729    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  62.27 
 
 
550 aa  728    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  100 
 
 
547 aa  1132    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  74.82 
 
 
549 aa  866    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  62.62 
 
 
605 aa  715    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  59.7 
 
 
549 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  75 
 
 
549 aa  871    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  58.88 
 
 
548 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  57.17 
 
 
548 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  67.28 
 
 
568 aa  799    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  58.47 
 
 
552 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  57.75 
 
 
549 aa  692    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  75.37 
 
 
550 aa  892    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  60 
 
 
550 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  54.65 
 
 
561 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  54.34 
 
 
553 aa  625  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  50 
 
 
575 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  48.98 
 
 
566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  49.45 
 
 
566 aa  571  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  50 
 
 
575 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  49.82 
 
 
575 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  49.82 
 
 
575 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  50.74 
 
 
576 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  49.45 
 
 
575 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  52.04 
 
 
576 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  50.37 
 
 
576 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  49.26 
 
 
562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  49.45 
 
 
575 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 
566 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
576 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  50.55 
 
 
572 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
576 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
576 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  48.88 
 
 
564 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  49.45 
 
 
575 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  50.91 
 
 
577 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  50.83 
 
 
576 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
576 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
570 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  50.47 
 
 
562 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  50.54 
 
 
577 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
576 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  49.36 
 
 
560 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 
552 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
576 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  52.66 
 
 
843 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  48.32 
 
 
564 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  49.36 
 
 
576 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  48.32 
 
 
576 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  48.26 
 
 
570 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  48.26 
 
 
570 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  48.26 
 
 
570 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  49.08 
 
 
584 aa  550  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  49.63 
 
 
546 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  49.63 
 
 
546 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  48.53 
 
 
602 aa  548  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  50.1 
 
 
605 aa  550  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  48.16 
 
 
570 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  49.73 
 
 
579 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  47.45 
 
 
578 aa  548  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  47.79 
 
 
578 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  49.26 
 
 
546 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  49.17 
 
 
601 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  48.35 
 
 
544 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  48.26 
 
 
570 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  47.79 
 
 
570 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  49.44 
 
 
570 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  47.63 
 
 
578 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  47.61 
 
 
574 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  46.58 
 
 
564 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  47.77 
 
 
538 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  48.5 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  48.71 
 
 
596 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  47.62 
 
 
574 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  47.05 
 
 
571 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  46.75 
 
 
557 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  48.52 
 
 
570 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  46.49 
 
 
571 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 
568 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  46.79 
 
 
540 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  47.04 
 
 
562 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  47.31 
 
 
557 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  48.51 
 
 
578 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  49.35 
 
 
596 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  46.85 
 
 
557 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 
551 aa  534  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  46.86 
 
 
571 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  46.97 
 
 
540 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>