More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1041 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 
549 aa  673    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  59.74 
 
 
552 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  81.27 
 
 
550 aa  946    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  64.09 
 
 
563 aa  726    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  100 
 
 
549 aa  1125    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  59.37 
 
 
549 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  60.44 
 
 
550 aa  690    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  74.86 
 
 
552 aa  867    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  59.07 
 
 
560 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  59.55 
 
 
552 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  59 
 
 
549 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  57.09 
 
 
550 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  74.82 
 
 
547 aa  866    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  96.9 
 
 
549 aa  1094    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  97.45 
 
 
549 aa  1101    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  58.58 
 
 
548 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  56.67 
 
 
548 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  67.22 
 
 
568 aa  786    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  58.44 
 
 
552 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  59.89 
 
 
549 aa  695    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  60.88 
 
 
605 aa  686    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  58.58 
 
 
550 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  56.9 
 
 
549 aa  628  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  56.66 
 
 
554 aa  631  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  54.34 
 
 
561 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  55.97 
 
 
544 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  53.92 
 
 
553 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  51.02 
 
 
571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 
566 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  48.88 
 
 
566 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  50.37 
 
 
566 aa  557  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  49.17 
 
 
562 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  48.72 
 
 
575 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  51.87 
 
 
605 aa  551  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  48.54 
 
 
575 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  50.37 
 
 
546 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  48.54 
 
 
575 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  50.56 
 
 
578 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  49.82 
 
 
546 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  52.04 
 
 
577 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 
843 aa  545  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 
576 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  52.03 
 
 
577 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  48.72 
 
 
575 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  51.78 
 
 
601 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  50.56 
 
 
578 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  49.54 
 
 
552 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 
544 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  48.59 
 
 
564 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  47.81 
 
 
575 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  50 
 
 
562 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  50.65 
 
 
572 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  49.45 
 
 
560 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  48.98 
 
 
602 aa  537  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  49.53 
 
 
575 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  48.24 
 
 
557 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  47.78 
 
 
562 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  49.17 
 
 
584 aa  534  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  48.24 
 
 
540 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  46.68 
 
 
557 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  47.83 
 
 
564 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  48.42 
 
 
540 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  48.18 
 
 
575 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  48.42 
 
 
540 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  48.98 
 
 
596 aa  533  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  47.87 
 
 
538 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  47.41 
 
 
557 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  48.14 
 
 
546 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  47.65 
 
 
576 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  48.6 
 
 
558 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  49.26 
 
 
576 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  50.28 
 
 
579 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  48.6 
 
 
578 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 
551 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  48.93 
 
 
570 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  49.17 
 
 
570 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  49.17 
 
 
570 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  47.96 
 
 
564 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  46.63 
 
 
576 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  46.63 
 
 
576 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  47.48 
 
 
578 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  46.63 
 
 
576 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  47.59 
 
 
549 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  46.63 
 
 
576 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  49.17 
 
 
576 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  48.25 
 
 
570 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  46.63 
 
 
576 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  48.79 
 
 
574 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  46.63 
 
 
570 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  46.45 
 
 
576 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  46.65 
 
 
571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  47.7 
 
 
576 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  47.21 
 
 
571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  47.56 
 
 
566 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  47.51 
 
 
568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  48.62 
 
 
576 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  46.37 
 
 
564 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  48.68 
 
 
570 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  48.31 
 
 
570 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  46.67 
 
 
1043 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>